这两项研究分别构建了甜瓜和西瓜的全基因组变异图谱-柴静新闻调查-朝日新闻网
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研究所性状-这两项研究分别构建了甜瓜和西瓜的全基因组变异图谱-朝日新闻网

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杨天真删博

中國農科院鄭州果樹研究所研究員徐永陽說,其所在團隊聯合中國農科院深圳農業基因組研究所、西班牙巴塞羅那基因組中心及中國農科院蔬菜花卉研究所、青島農業大學、中國農業大學、美國康奈爾大學、法國農業科學院等19個國內外科研機構,歷時5年,共同構建了世界第一個甜瓜全基因組變異圖譜,首次系統闡釋了甜瓜的複雜馴化歷史及重要農藝性狀形成的遺傳基礎。甜瓜研究團隊分析了千余份甜瓜種質資源的基因組變異,共鑒定了560萬個SNP。

前不久,國際學術期刊《自然-遺傳學》(Nature Genetics)以兩篇長文形式在線發表了兩項由中國農業科學院聯合國內外單位開展的瓜類作物基因組研究成果。這兩項研究分別構建了甜瓜和西瓜的全基因組變異圖譜,揭示了兩種水果的馴化歷史及果實品質的遺傳分子機制。

來自中國農科院的消息稱,這兩項成果為西甜瓜種質資源研究提供新的理論框架和組學數據,也為西甜瓜分子育種提供了大量的基因資源和選擇工具,具有重要科學價值和實踐意義。相關成果的發表將進一步強化我國在瓜類作物基因組學與分子育種領域的國際領先地位。

在此基礎上,科研團隊發現甜瓜可能發生過3次獨立的馴化事件,其中一次發生在非洲地區,另外兩次發生在亞洲地區並分別產生了厚皮甜瓜和薄皮甜瓜兩個栽培亞種。3次獨立馴化「異曲同工」,都導致野生甜瓜失去了苦味和酸味並獲得了甜味。此外,通過全基因組關聯分析等手段,定位了200餘個與甜瓜苦味、酸味、果實大小、果肉顏色等性狀相關的候選基因和位點。

中國青年報·中國青年網記者 邱晨輝

中國農科院深圳農業基因組研究所研究員黃三文所在的團隊,則協同鄭州果樹研究所、北京市農林科學院、美國康奈爾大學組成聯合攻關團隊,採用單分子測序、光學圖譜與Hi-C三維基因組聯合分析,完成了高質量的西瓜基因組序列圖譜。繼而對400多份種質資源開展了基因組變異分析,共鑒定近2000萬個SNP。

【編輯:張燕玲】

瓜兒為什麼這樣甜西瓜、甜瓜,為什麼是甜的?科學家找到了最新的解釋。

在此基礎上,科研團隊首次明確了西瓜7個種之間的進化關係,發現野生黏籽西瓜是距現代栽培西瓜親緣關係最近的種群,也發現了利用野生西瓜進行抗性改良的基因組痕迹。此外,鑒定獲得了與果實含糖量、瓤色、形狀等性狀關聯的43個信號位點,提供了關鍵候選基因。

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